Fundado en 1987 el Jaén Fútbol Sala ha competido con diferentes nombres a lo largo de su historia. El conjunto jienense fue creciendo desde su fundación hasta lograr el primer ascenso a División de Honor en la temporada 1991/92. Con diferentes ascensos y descensos logró ascender definitivamente a la máxima categoría de la LNFS en la 2012/13. En lo que a trofeos respecta en sus vitrinas cuenta con dos Copas de España logradas en 2015 y 2018. Además ha estado cerca de levantar más títulos llegando a ser dos veces subcampeón de la Copa del Rey (2018 y 2019) y Supercopa de España (2015/16 y 2018/19).
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